做质粒整理、基因构建或者分析测序结果的时候，调整序列上的注释标签是常有的事。关于在DNASTAR里怎样编辑序列的注释信息，通常都是在SeqBuilder Pro的Features视图下完成的，也可以直接在序列图上改动Feature的属性；而想要修改这些注释标签的显示顺序，主要牵扯到的就是Features列表的排序方式、不同图层的显示规则，以及标签在图形里的摆放位置。SeqBuilder Pro这款软件支持添加、编辑和自定义注释，也能够进行自动注释和Feature显示管理。

　　一、DNASTAR怎么编辑序列注释标签

　　在动手改注释之前，最好先看看当前这个序列文件用的是哪种格式，因为不同格式对Feature的保存能力不一样，普通的FASTA文件往往只记下序列本身，注释信息很容易丢失，如果想长期完整地保留这些注释，用GenBank格式或者SeqBuilder自己的格式会更保险一些。

　　1、打开Features视图

　　导入序列以后，把界面切到Features视图下面，按照SeqBuilder Pro的说明，这个视图会把当前DNA或蛋白序列上带有的注释列成一张清单，上面能看到每一项Feature叫什么名字、处在哪个位置上，以及它属于什么类型。

　　2、修改已有注释标签

　　在Features列表里双击想要修改的那条Feature，或者右键选编辑，弹出来的属性窗口能改动Feature的名称、类型、颜色、方向和显示方式，比如把原来标注的misc_feature改成CDS，或者给不同类型的Feature配上不同的颜色，这样启动子、抗性基因等功能区域一眼就能区分清楚。

　　3、新增注释标签

　　要是某段序列上还空着没有标注，就可以先在序列视图里用鼠标框选出想要标记的那段碱基区间，然后通过Features菜单下的New Feature来创建，这不仅能添加普通注释，也可以专门建一个带翻译信息的CDS注释，对标记编码区来说非常方便。

　　4、修改翻译和阅读框

　　对于CDS这类会自动关联蛋白翻译的Feature，如果发现翻译出来的氨基酸序列看起来不对，那就需要回头检查一下翻译的起始位置、方向，还有阅读框有没有弄错，SeqBuilder Pro自身能够显示开放阅读框和翻译框架，借助Translations and ORFs这类工具切换不同的阅读框，一直换到翻译结果和预期相符为止。

　　二、DNASTAR注释标签显示顺序怎么修改

　　注释标签在图上的排列顺序要是不合理，质粒图和线性图里的文字就很容易相互遮挡，尤其在Feature特别多的载体上，软件默认排出来的顺序常常会显得比较混乱。

　　1、在Features view中调整排序

　　在Features视图的那个列表里，可以试着按名称、起始位置、长度或者类型去重新排一下序，有些版本直接用鼠标点一下表头就能在升序和降序之间切换，如果只是列表看着有点乱，一般只要让它们按在序列上的位置从小到大再排一遍，就会清楚不少。

　　2、修改Feature显示层级

　　在图形显示时，有的Feature会被自动推到更外圈的地方，另一些则紧贴着中间的序列主体，当Feature数量实在太多时，可以先把那些辅助性的标签临时隐藏起来，只留下CDS、启动子和抗性基因这些最核心的部分，等图面清爽了再统一调整版面。

　　3、调整Circular Map和Linear Map显示

　　在环形图或者线性图模式下，标签的位置是可以用鼠标直接拖动的，把挤在一起的文字拉开一些就能避免重叠，DNASTAR的官方教程里也提到过，SeqBuilder允许直接在质粒图上重新去排列和编辑那些注释，摆在哪里完全可以根据需要来定。

　　4、通过Feature Library统一样式

　　要是项目里有很多性质差不多的注释，一个一个去调既费时又容易不统一，这时候就可以进入Feature Library Manager，集中管好这些Feature的显示规则，按照官方文档的说明，这个管理器能够控制Feature在管理界面和最终注释结果里的呈现方式，设定好以后就能保持统一。

　　三、DNASTAR注释显示异常怎么处理

　　等标签都调整过一遍之后，要是发现它们在图上还是显得乱，文字重叠在一起，甚至有些标签干脆不见了，这多半就跟视图设置、文件的格式，还有Feature本身划定的范围有关。

　　1、检查Feature区间

　　标签显示异常时，可以先看一下Feature覆盖的区间，如果它的起止位置超出了序列的实际长度，或者方向被设反了，那标签显示不正常就不奇怪了，特别是那些落在反向链上的Feature，一定要确认有没有被正确设置成反向互补方向，不然箭头和文字都会对不上。

　　2、检查文件格式

　　保存文件时要注意，如果顺手把一个带完整Feature的序列另存成普通FASTA，很多注释信息就会悄悄丢掉，要想以后再打开时注释都还在，那保存的时候就该用SeqBuilder自己的格式，或者GenBank格式，这两种对Feature的支持要好很多。

　　3、检查阅读框和翻译

　　遇到CDS这类标签显示异常，首先就该怀疑是不是开放阅读框的设定出了问题，SeqBuilder能够把不同阅读框下面的ORF区域都显示出来，要是阅读框挑错了，翻译出来的蛋白长度就会不对劲，Feature的显示也会跟着受影响。

　　4、重新刷新布局

　　Feature一多的时候，环形图不一定立刻就把版面重新调好，这时可以先切到线性图模式，再重新切回环形图，或者干脆把文件关掉再打开一次，让软件重新计算一遍所有标签应该摆放的位置，很多显示上的小毛病自己就会消掉了。

　　总结

　　在DNASTAR里编辑序列的注释标签，最常用的办法就是在Features视图中修改Feature的各项属性，或者通过Features菜单去新建Feature和CDS注释；要调整这些标签在图上的显示顺序，关键就是管好Features列表的排序、图层的显示设置，还有环形图和线性图里的布局；当图上的标签太多太杂的时候，先把核心的注释筛选出来，再把它们的颜色和显示规则统一好，这样图谱看起来就会清楚很多。