病毒基因组信息可用于研究病毒的致病机理和进化，以及协助疫苗开发和疫苗耐药性研究。现在可以通过表征来自不同宿主甚至单个个体的病毒基因组来详细探索病毒突变。例如，在过去两年中发现了数千种 SARS-CoV-2 变体，其中包括世界卫生组织在本书出版时确定的几种“令人担忧的变体” 。